机电工程系是学院最早成立的系之一，现开设工业机器人技术（五年制高职）、城市轨道交通运营管理（五年制高职）、机电一体化技术、智能制造技术应用、工业机器人应用与维护、城市轨道交通车辆运用与检修6个专业。其中2个专业为国家中等职业教育改革发展示范学校重点建设专业，1个专业为国家高技能人才培训基地重点建设专业。

　　机电工程系拥有一支教学经验丰富、实践能力强的“双师型”教师队伍，现有专业教师32人，半数以上具有海外学习经历，其中硕士14人，教授、副教授14人，讲师8人，技师以上25人，先后聘用30余名行业、企业技术人员担任兼职教师。现有全国模范教师1人，全国交通技术能手6人，省技术能手、五一创新能手、教学名师、专业带头人、青年岗位能手等共26人。系在籍学生1600余人。

　　机电工程系的校内实训基地集教学、生产、科研为一体，建有智能制造、机器人技术2个省级实训基地和工业机器人、城市轨道交通运营管理2个国家高技能人才培训基地，拥有数控车铣、智能制造物流管理、电工电子、PLC、工业机器人、移动机器人、城市轨道交通综合实训等19个实训场（室），可同时容纳1000余名学生同时进行实训教学。先后与50多家大中型企业建立了长期稳定的校企合作关系，成立大亚工学院、智能制造学院2个产业学院，充分满足学生校内、外实习及就业需求。毕业生双证合格率达100%，初次就业率达99%以上。

　　系师生在2023年第二届江苏省智能硬件装调职业技能竞赛智能硬件系统集成赛项中获两个冠军

　　系师生在2023年全国设备管理与智能运维行业职业技能竞赛全国总决赛获二等奖

　　系教师在2023年江苏省工业和信息化技术技能大赛暨全国大赛江苏选拔赛获第二名

　　邓浩、董长健、史闯、王俊、臧吕飞、刘杰等同学成功申报《一种工业机器人用机械抓取装置》《一种生产车间用PLC实训台》等5项国家专利，均已获得授权